去二号机的一种隐性补偿安抚，亦或是基於陈瑜在技术领域展现出的可靠性与基路伯系统本身所证明的战术价值。
NERV高层在审阅了陈瑜提交的、关於全面提升三号机性能与武器整合度的详细方案後，较为顺利地批准了该项计划。 尽管对於失去二号机依旧感到深深的失落，但陈瑜为她铺设的这条新路径，以及其中蕴含的信任与期许，像一道微光，照亮了她此刻灰暗的心境。
这意味着，EVA三号机，这台经历了使徒寄生、强制剥离与大规模修复的机体，其後续的深度改造与系统集成权限，在很大程度上落入了陈瑜的掌控之中。
他获得了按照自身技术构想，对其进行更进一步塑造的机会，使其在实质上，开始更多地打上属於他个人的印记。
改造计划的第一步，是外部标识的变更。 在她心中，陈瑜博士已然成为了一个能够理解她、支持她，并能为她带来转机和价值认可的、不可或缺的存在。
陈瑜提出，为了与原先被第九使徒寄生过的状态进行明确区分，也为了契合新装备系统的视觉识别，建议更改三号机的涂装方案。
而陈瑜，则成功地将一位重要的战力，更牢固地纳入了自己的影响范围，并为後续对三号机的进一步改造，铺平了道路。 这一提议得到了批准。
於是，在格纳库内，三号机原本以深色为主的装甲被逐一拆卸、处理，重新喷涂。 或许是由於对明日香失去二号机的一种隐性补偿安抚，亦或是基於陈瑜在技术领域展现出的可靠性与「基路伯」系统本身所证明的战术价值。
新的涂装以白色作为主色调，取代了原先的深色，并在肩部、胸甲以及腿部关键区域，添加了鲜明而富有科技感的红色条纹。
NERV高层在审阅了陈瑜提交的、关於全面提升三号机性能与武器整合度的详细方案後，较为顺利地批准了该项计划。 当涂装完成，整台机体焕然一新，白色的主体显得冷峻而肃穆，跳跃的红色条纹则暗示着其内蕴含的强大力量与攻击性。
这台新的三号机，在外观上已与过去截然不同，视觉上更具辨识度，也清晰地宣告了其进入了一个由陈瑜主导的新阶段。
当然，改造远不止於涂装。
陈瑜系统地推进了他的「基路伯」全系统集成。
肩部加装了标准接口的多功能榴弹发射器模块，手臂与腿部装甲内部预留了用於搭载「基路伯—I型」手雷的快速释放装置。
背部接口经过重新设计
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